Microbiología Clínica: Toma, Manipulación y Transporte de Muestras

La principal preocupación del microbiólogo clínico es aislar e identificar con rapidez microrganismos a partir de muestras clínicas. 

1. la muestra clínica seleccionada debe representar adecuadamente el área enferma y puede incluir también otros lugares (p. ej., hígado o muestras de sangre), con el fin de aislar e identificar los agentes potenciales del proceso patológico en cuestión.

2. Se debe obtener la cantidad de muestra adecuada para realizar diversas pruebas diagnosticas. 

3. Se debe prestar atención a la recogida de la muestra con el fin de evitar la contaminación por las numerosas variedades de microrganismos que habitan normalmente en la piel y las mucosas. 

4. La muestra debe trasladarse con rapidez al laboratorio.

5. Si es posible, se debe obtener la muestra antes de haber administrado antimicrobianos al paciente.

Toma de muestra:

• El método mas frecuente empleado para tomar muestras (p. ej., pus) de la piel y las mucosas (ojos, oído, nariz, garganta, heridas abiertas) es el hisopo estéril. El hisopo es un aplicador de poli estireno con la punta de rayón o de dacrón.

• El aspirador con aguja se emplea para recoger asépticamente (p. ej., bacterias anaeróbicas) muestras de liquido cefalorraquídeo o de sangre. Con el fin de impedir la coagulación de la sangre y que los microrganismos queden atrapados, en las muestras se incluyen diversos anticoagulantes.

• La intubación es la inserción de un tubo en un conducto corporal o víscera hueca. Por ejemplo, se puede emplear la intubación para recoger muestras del estomago. En este procedimiento, se conecta un tubo estéril largo con una jeringa, y el tubo es deglutido por el paciente o se introduce a través de un orificio nasal al estomago del paciente. Un ejemplo de sonda empleada lo es la de Levin.

• Un catéter o sonda es un instrumento tubular que se emplea para extraer líquidos de una cavidad corporal o inducirlos en ella. Por ejemplo, la orina se recoge con sondas. Para la orina se emplean tres tipos de sondas. La sonda rígida se emplea cuando la uretra es muy estrecha o tiene estenosis. la sonda de French es un tubo blando que se emplea para obtener una única muestra. Si son necesarias múltiples muestras  a lo largo de un periodo prolongado, se usa una onda de Foley.

• La mayor parte de las muestras de vías respiratorias inferiores se obtiene  a partir del esputo. En concreto, el esputo es la secreción de las glándulas salivales. El esputo se recoge en frascos especialmente diseñados.

Manipulación:

Inmediatamente después de la recogida, es necesario etiquetar adecuadamente la muestra. La persona que recoge la muestra es responsable de asegurase que el nombre, numero de identificación y localización del paciente queden correctamente escritos o impresos en la petición de cultivo. Esta información debe corresponder con la escrita o impresa en una etiqueta adherida al recipiente de la muestra. También deben quedar especificados en la petición el tipo o procedencia de la muestra y las pruebas solicitadas.

Transporte:

La rapidez con la que la muestra se transporta al laboratorio una vez obtenida tiene una importancia capital. Algunos laboratorios rechazan muestras cuyo transporte se ha prolongado excesivamente. 

Las muestras microbiológicas se pueden transportarse al laboratorio por varios procedimientos. Por ejemplo, ciertas muestras deben ser transportadas en un medio que preserve los microrganismos y ayude a mantener la proporción de unos con otros. Esto tiene una importancia especial en aquellas muestras en las que puede haber microrganismos normales mezclados con microrganismos ajenos a ese lugar del cuerpo.

Cuando se sospecha la existencia de anaerobios es necesario un tratamiento especial. El material se aspira con aguja o jeringa. En la mayor parte de los casos, lo mas practico es retirar la aguja, tapar la aguja con su tapón original y llevar la muestra directamente al laboratorio clínico.

El transporte de estas muestras no debe prolongarse mas allá de 10 minutos; en caso contrario, es necesario inocular la muestra de forma inmediata en un vial de transporte anaerobios. Los viales deben contener un medio de transporte con un indicador, como por ejemplo la resazurina, para mostrar que el interior del vial es anaerobio en el momento de introducir la muestra.

Las muestras obtenidas con hisopo para cultivo de anaerobios son menos satisfactorias que las aspiradas o las muestras de tejido, incluso cuando son transportadas en un vial para anaerobios. Muchos laboratorios clínicos insisten en que las muestras de heces para cultivo sean transportadas en diversos conservantes tamponados. La preparación de estos medios de transporte se describe en diversos manuales.

El transporte de las muestras de orina al laboratorio se debe hacer lo antes posible. No debe transcurrir más de una hora entre el momento de la obtención de la muestra y el de su examen. Si no se puede respetar este horario, la muestra de orina debe enfriarse de inmediato.

El liquido cefalorraquídeo (LCR) de los pacientes en los que se sospecha meningitis debe ser examinado de inmediato por personal entrenado en el laboratorio de microbiología clínica. Se debe obtener por punción lumbar, en condiciones estrictamente asépticas. La muestra se transporta en hielo al laboratorio. Las muestras para aislamiento de virus también se introducen en hielo antes del transporte. En el laboratorio las muestras para virus se refrigeran o congelan si no se van a estudiar inmediatamente.